Отдел осуществляет свою деятельность в соответствии с Конституцией Республики Казахстан, Законом Республики Казахтан от 10 июля 2002 года «О ветеринарии», иными нормативными правовыми актами Республики Казахстан, а также настоящим Положением.

Отдел ведет ветеринарный учет и отчетность и представляет их в порядке, установленном законодательством Республики Казахстан в области ветеринарий.